Герман Протопопов начал работать на Ижевском механическом заводе в конце 1950-х — в 1958 году он пришел на предприятие, которое сегодня известно как часть концерна «Калашников». Первые шаги в профессии он делал слесарем-сборщиком в легендарной Школе ружейного мастерства. Уже через несколько лет, в 1961 году, Протопопова перевели в отдел главного конструктора. Здесь он совмещал работу с учебой — по вечерам посещал Ижевский механический институт, где продолжал повышать свою квалификацию.
Свою конструкторскую карьеру Герман Яковлевич начал с разработки охотничьего оружия. При его участии на заводе освоили серийное производство моделей ИЖ-58М и ИЖ-18Е, которые стали весьма популярны среди охотников. Особого внимания заслуживает и его работа над ружьем ИЖ-27: для него Протопопов сконструировал эжекторный механизм, позволявший автоматически извлекать стреляные гильзы — значительное удобство для стрелков.
Настоящая конструкторская звезда Протопопова раскрылась в 1973 году, когда он возглавил конструкторское бюро пневматического оружия на Ижевском механическом заводе. В ту эпоху пневматика в СССР только набирала популярность, а Протопопов стал одним из тех, кто задал высокий технический и качественный стандарт в этой области.
Ему принадлежит идея применения компрессионного принципа — когда пуля покидает ствол благодаря энергии заранее сжатого воздуха. Под его руководством была создана целая серия спортивного пневматического оружия: винтовки ИЖ-32, ИЖ-32КБ, пистолет ИЖ-33. Эти модели начали массово производиться в конце 1970-х. Вскоре появились и модернизированные версии: пистолет ИЖ-33М и винтовка ИЖ-32М.
Однако заслуги Германа Яковлевича не ограничивались только спортивными образцами. Благодаря его работе пневматическое оружие стало по-настоящему массовым в Советском Союзе. Под его руководством на конвейер поставили такие модели, как пистолет ИЖ-40 и винтовка ИЖ-38 — доступные, надежные, долговечные. Эти образцы получили широкое распространение и были востребованы не только у спортсменов, но и среди широкой аудитории стрелков-любителей.
За годы своей работы Герман Протопопов стал автором 23 изобретений, каждое из которых укрепляло позиции Ижевского механического завода как лидера в области пневматического оружия. Не случайно его вклад в развитие отрасли был отмечен высокой государственной наградой — премией Совета Министров СССР.
Ижевский механический завод, вошедший в состав концерна «Калашников», по сей день остается одним из крупнейших производителей пневматического оружия. В этом — немалая заслуга Германа Яковлевича Протопопова. Его инженерный талант, внимание к деталям и преданность своему делу позволили советской пневматике выйти на новый уровень и занять достойное место в мировой оружейной индустрии.